
26 Eylül'de oynanacak 2. kademe kura çekiminde 2006-2007 sezonunda Süper Lig'de 5-15 arasında yer alan takımlar, TFF 1. Lig'den Süper Lig'e yükselen 3 takım ve ilk kademeden gelen 18 takımla birlikte toplam 32 takım yer aldı.
2. kademe maçları tek maçlı eleminasyon sistemine göre oynanacak. Maçların normal süresinin berabere bitmesini durumunda uzatma dakikalarına geçilecek, yine eşitlik bozulmazsa penaltı atışlarına geçilecek. Çekilen 2. kademe kurularına göre eşleşmeler şu şekilde oldu:
Tepecik Belediyespor - Ankaragücü
Arsinspor - Denizlispor
Şanlıurfaspor - Konyaspor
Gençlerbirliği Oftaşspor - Uşakspor
Alanyaspor - Sivasspor
Kayserispor - Diyarbakırspor
Sarıyer - Kasımpaşa
Çaykur Rizespor - Eskişehirspor
Bursaspor - Boluspor
İstanbul Büyükşehir Belediyespor - Gaziantep Büyükşehir Belediye DİSKİSpor
Gaziantepspor - Kayseri Erciyesspor
Ankaraspor - Kartalspor
Vestel Manisaspor - Gaziantep Büyükşehir Belediyespor
Gençlerbirliği - Akçaabat Sebatspor
Adana Demirspor - Altay
MKE Kırıkkalespor - Sakaryaspor
Ankaragücü Kulübü Başkan Vekili Serdar Özersin ve Gaziantepsor Kulübü Genel Menajeri Hasan Çetinkaya, kura çekiminin bütün takımlara hayırlı olmasını dileyerek, Fortis Türkiye Kupası'nda gruplara kalmak istediklerini söylediler.
Fortis Türkiye kupasında rakipimizin alanyaspor olması çok iyi oldu bu turu atlarız diyorum ama yinede cekincelerim var cünkü kupa macları değişik bir hava içinde geciyor gecmiş tarihlerde bunun en bariz örneklerini yaşadık gecen dönemde bizim başımıza gelmedimi? hatta biraz daha gecmişe gidersek sözde büyüklerin nasıl hüsrana uğradıklarını görürüz aman allah bizi bu türlü kötü olaylardan korusun sivasspor bu turu rahat atlar diyorum